Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube2kP61087 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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