Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ActbP60710 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ActbP60710 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms