Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P58686 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P58686 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P58686 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P58686 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P58686 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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