Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Paxbp1P58501 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Paxbp1P58501 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms