Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smpdl3bP58242 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms