Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snrpa1P57784 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms