Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SmoP56726 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SmoP56726 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SmoP56726 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SmoP56726 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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