Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lim2P56563 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lim2P56563 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms