Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rrp1P56183 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrp1P56183 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms