Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bp1P55194 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms