Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aqp4P55088 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms