Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GemP55041 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GemP55041 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GemP55041 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GemP55041 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GemP55041 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GemP55041 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms