Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb3P54754 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms