Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad23aP54726 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rad23aP54726 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms