Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms