Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PctpP53808 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PctpP53808 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PctpP53808 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PctpP53808 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms