Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RabggtbP53612 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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