Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lbx1P52955 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lbx1P52955 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lbx1P52955 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Lbx1P52955 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lbx1P52955 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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