Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkmP52480 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PkmP52480 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PkmP52480 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PkmP52480 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms