Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ClgnP52194 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms