Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Apobec1P51908 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms