Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms