Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa10P50708 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms