Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FmodP50608 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FmodP50608 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms