Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SftpbP50405 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SftpbP50405 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms