Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SftpdP50404 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms