Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpreP49446 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms