Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prox1P48437 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms