Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcd1P48410 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcd1P48410 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms