Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TgfaP48030 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TgfaP48030 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TgfaP48030 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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