Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scg3P47867 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms