Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gli1P47806 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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