Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zic1P46684 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms