Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rab11bP46638 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms