Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klf1P46099 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf1P46099 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms