Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PtgfrP43117 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtgfrP43117 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms