Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gdf5P43027 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gdf5P43027 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf5P43027 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf5P43027 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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