Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkx1-2P42580 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkx1-2P42580 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms