Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tnfsf9P41274 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf9P41274 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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