Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VhlP40338 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VhlP40338 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VhlP40338 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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