Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd9P40240 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms