Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fen1P39749 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms