Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Traf2P39429 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Traf2P39429 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms