Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TtlP38585 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TtlP38585 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TtlP38585 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TtlP38585 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtlP38585 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtlP38585 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtlP38585 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtlP38585 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms