Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgclP38060 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HmgclP38060 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HmgclP38060 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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