Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ddit3P35639 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms