Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rfc1P35601 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms