Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms