Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms