Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sftpa1P35242 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sftpa1P35242 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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